基金监管部1997年10月开始运作，1998年9月正式成立。主要职责是：草拟监管证券投资基金的规则、实施细则；审核证券投资基金、证券投资基金管理公司的设立，监管证券投资基金管理公司的业务活动；与有关部门共同审批证券投资基金托管机构的基金托管业务资格，并监管其基金托管业务；监管证券投资基金的销售和运作；合格境外机构投资者（QFII）的审批及监管，境外资产管理机构在华设立代表处的审批。

基金监管部下设六个处，即综合处、监管一、二、三、四、五处，各处职责如下：

综合处：负责部内行政文秘事务、综合协调、基金信息报送和数据统计、对外信息发布；

监管一处：负责拟定基金管理公司及高管人员业务规则并实施监管；

监管二处：负责拟定托管银行业务规则并实施监管，负责基金信息披露、基金投资与交易行为监管；

监管三处：负责拟定基金产品的业务规则并实施监管；

监管四处：负责拟定合格境外机构投资者（QFII）、基金管理公司合格境内机构投资者（QDII）等国际业务规则并实施监管；

监管五处：负责拟定基金销售的业务规则并实施监管。